Culture axenique
Principe
Une culture axénique est une culture dans laquelle on retrouve qu’une seule espèce, variété ou souche d’un organisme. Ce type de culture est exempte de tout autre organisme contaminant.
La culture axénique peut se faire avec des bactéries, des eucaryotes unicellulaires ou multicellulaire.
Préparation
Le point de départ d’une culture axénique est une culture mixte existante. A partir de là, on produit des sous-cultures. On les dilue successivement jusqu’à obtenir une culture de quelques organismes individuels afin de pouvoir les identifier. Une fois l’organisme désiré identifié, on le sélectionne pour produire une culture composée uniquement de cet individu-ci. ainsi, une culture axénique est formée.
Une fois une culture axénique formée, on la contrôle régulièrement de sorte à ce qu’elle reste axénique, c’est-à-dire dépourvue d’organismes contaminant. On prend alors un échantillon de cette culture et on l’étale sur une plaque de gélose. Le milieu est enrichi pour favoriser la croissance d’organismes contaminants. On la laisse incuber pendant une certaine période. Si la culture n’est plus axénique, des organismes contaminants se développeront et pourront être identifiés.
Indications
Deux points doivent être pris en compte lors de la préparation d’une culture axénique.
- La première consiste à utiliser des matériaux stérilisés afin d’éliminer les micro -organismes préexistants qu’ils contiennent.
- Le second implique d’isoler et de cultiver un seul micro-organisme et, ainsi, de produire un clone en tant que descendant.
Avantages
Puisque les cultures axéniques sont issues souvent d’un seul individu, tous les organismes qui descendent de cet individu partagent un pool génétique identique (sans prendre en compte les mutation et le transfert génétique horizontal).
En utilisant une culture avec des individus génétiquement identiques, ces mêmes individus répondront de manière plus uniforme et l’expérience pourra être reproduite plusieurs fois. Cela permet de simplifier l’interprétation des expériences.
Inconvénients
La culture axénique peut se montrer très complexe pour certains agents infectieux. Elle nécessite des conditions bien particulières.
- Par exemple, les parasites intracellulaires se développent dans des tissus d’hôtes. Par ces propriétés bien spécifiques, ce milieu in vivo est difficile de le reproduire en in vitro.
Mais, pour d’autres agents infectieux intracellulaires, on peut plus facilement modifier le milieu d’accueil en ajoutant certains métabolites ou en modifiant son atmosphères.
- Par exemple, C.burnetii est une bactérie intracellulaire qui peut être mis en culture au moyen de cellules eucaryotes, de métabolites d’accueil et d’oxygène dissous.
Références
Thain, M. Hickman, M. Dictionary of biology (9th edition). Penguin Books, London, lu sur stringfixer.com
JB Middlebrook; RO Bowman « Preparation of Axenic Cultures of Algae Using a French Press ». Journal of Applied Microbiology. lu sur stringfixer.com
Omsland, Anders; et al. (2009). « Growth without host cells of the Q fever bacterium Coxiella burnetii ». lu sur stringfixer.com