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Haemophilus influenzae - Bacille de Pfeiffer

Proteobacteria (phylum), pasteurellales (famille)

Biologie de la bactérie

Il s’agit d’une bactérie aéro-anaérobie facultative qui se présente sous la forme d’un coccobacille à Gram négatif, immobile au microscope. Certaines souches sont encapsulées, ce qui leur confère une plus grande virulence (le type B particulièrement). Les formes non-encapsulées, non typables font partie de la flore commensale du tractus respiratoire supérieur.

Ecologie et réservoir de transmission

Retrouvé chez l’homme exclusivement, la bactérie se transmet par gouttelettes de salives et sécrétions nasales.

Les enfants plus âgés et les adultes semblent constituer le réservoir primaire de la bactérie.

Il existe une variation saisonnière avec un pic hivernal. Dans les pays à faibles et moyens revenus, où la couverture vaccinale est moindre, on observe une distribution bimodale des infections, ciblant les enfants ainsi que les personnes âgées.

Maladie et présentation clinique

Le portage asymptomatique est beaucoup plus présents chez les personnes non-vaccinées que chez les vaccinées (<1% chez ces dernières). La présentation clinique sera différente selon que la bactérie soit encapsulée ou non.

Non-encapsulées

Les souches non-encapsulées peuvent causer:

  • Otite
  • Sinusite
  • Pharyngite
  • Conjonctivite
  • Infections suppurées

Les non-encapsulées sont responsables d’infections opportunistes.

Encapsulées

Les souches encapsulées sont principalement représentées par le type HiB et sont responsables d’infections invasives.

Elles sont responsables de:

  • Méningites (50% des souches encapsulées peuvent causer cette atteinte)
  • Épiglottite (position tripode caractéristique chez les enfants atteints)
  • Bactériémies
  • Pneumonies
  • Ostéites
  • Arthrites
  • Vaginites

En ce qui concerne la méningite, le taux de mortalité reste élevé chez les jeunes enfants, allant de 5 à 60% selon qu’un traitement soit administré ou non. Par ailleurs, 20 à 40% des survivants présentes des séquelles importantes telles que:

  • Perte d’audition
  • Cécité
  • Retard mental et/ou moteur
  • Convulsions


Haemophilus influenzae
et la société

Les enfants de moins de 5 ans représentent le 90% des cas d’infections invasives à H. influenza, particulièrement dans les pays à faibles et moyens revenus. Il peut parfois provoquer des épidémies dans les garderies.

L’infection à H. influenzae touche autant les hommes que les femmes.

Diagnostic

Examen direct

Lors d’une méningite, l’examen direct du liquide céphalorachidien permet un prise en charge rapide. Dans le cas d’infections respiratoires, l’absence de flore polymorphe et la prédominance d’H. influenzae est indicateur d’une probable infection par cette bactérie.

Culture

Il s’agit d’une bactérie exigeante, nécessitant la présence concomitante de Facteur V (NAD+) et de Facteur X (hémine) afin de croître. On procédera alors soit à:

  • Une culture sur gélose chocolat (sang cuit), dans laquelle les Facteurs V et X sont naturellement présents.
  • Une culture par « satellistisme » (Camp-test) sur gélose au sang cru en présence d’une souche de Staphyloccocus aureus – qui, en hémolysant, va libérer le Facteur V.

La culture permet également de faire un antibiogramme afin de mettre en évidence les molécules auxquelles la bactérie est sensible.

La culture reste la technique de référence de diagnostic de H. influenza, mais le niveau de sensibilité peut être faible lors de la prise d’antibiotiques par les patients – on optera éventuellement dans ce cas pour une technique de diagnostique moléculaire.

 

Colonies d'Haemophilus influenzae sur gélose chocolat. Crédits: Stefan Walkowski, licence Creative Commons (CC BY-SA 4.0)

PCR

Pour certains échantillons (comme le liquide céphalo-rachidien ou un lavage broncho-alvéolaire), il est généralement possible de réaliser une PCR ciblant plusieurs germes usuels (PCR dite « multiplex »). Cette technique est utile si la culture est compromise – par exemple si le patient est sous thérapie antibiotique.

Prévention

Des vaccins contre H. influenzae type B sont disponibles depuis une trentaine d’années dans les pays à hauts revenus, pour lesquels la couverture vaccinale est de 92%, contre 42% dans les pays à faible et moyen revenu et 8% dans les pays à très faible revenu (Sciensano, rapport 2018).

  • Les populations-cibles sont les enfants en bas âge (dès 2 mois généralement et selon le schéma vaccinal du pays de résidence) ainsi que les patients immunosupprimés, transplantés ou ayant subi une splénectomie.
  • Les vaccins destinés aux nourrissons sont généralement des vaccins hexavalents regroupant une prévention contre plusieurs germes (diphtérie, coqueluche, poliomyélite, hépatite B notamment).

Traitement

Actuellement, environ 30-40% des souches de H. influenzae expriment une résistance à la bêta-lactamine.

Selon l’antibiogramme, on prescrira préférentiellement de l’amoxicilline, la co-amoxicilline (amoxicilline + acide clavulanique), une fluoroquinolone ou un macrolide.

Anecdotes

  • Richard Pfeiffer isola la bactérie pendant une épidémie de grippe (influenza) et, croyant avoir découvert là l’agent responsable de la maladie, l’a baptisé du nom d’Haemophilus influenza.
  • Le génome d’H. influenzae est le premier à avoir entièrement été séquencé (par la technique dite du « shotgun sequencing »). Ceci a permi la découverte des enzymes de restrictions, très utilisées en biologie moléculaire.
  • Dans les pays à haute couverture vaccinale contre H. influenza de type B, on note l’émergence de nouvelles souches responsables d’infections invasives et qui varient d’une région géographique à l’autre, posant un nouveau défi vaccinal

Références

  • Grammens T, Martiny D, Moens, Wyndham-Thomas C. Sciensano [En ligne]. Bruxelles (BEL) : Sciensano; 2018 [cité le 08.09.2021].
    Disponible ici.
  • https://www.sciensano.be/fr/biblio/surveillance-epidemiologique-des-infections-invasives-a-haemophilus-influenzae-2018, consulté le 08.09.2021
  • OMS, Normes de surveillance des maladies évitables par la vaccination, version du 5 septembre 2018 (consulté le 08.09.2021, disponible ici)