Stanislas Von Prowazek a eu un grand intérêt pour les sciences, la littérature et la philosophie dès le plus jeune âge.
Il a étudié les Sciences et Philosophies l’Université Charles à Prague puis à poursuivi son Doctorat à l’Université de Vienne. Il était un excellent observateur des caractéristiques des microbes au microscope et développa très vite une passion pour la description de leur morphologie. 

Von Prowazek était l’un des protozoologiste les plus versatiles de son époque avec un vaste champ d’intérêts.

En 1901 il a travaillé sur les maladies infectieuses et l’immunologie, puis en 1903, il a étudié la régénération des amoebiens et les spirochètes.

En 1906 , il voyagea en Indonésie pour étudier les infections de syphilis sur les Orang-Outans de l’île de Java. Il fut le premier à faire le lient entre Chlamydia Trachomatis et le trachome oculaire. 
En 1907, il dirigea l’institut de médecine tropical à Hambourg et publia un guide diagnostique sur les pathogènes protozoaires.

En 1915 fut envoyé dans un camp de prisonniers russes en Prussie pour investiguer les infections au typhus. Von Prowazek et son collègue Rocha Lima furent infecté et Von Prowazek en mourra quelques mois plus tard.